Innerhalb des DJW haben sich verschiedene inhaltliche und regionale Arbeitsgruppen gebildet:

• DAAD SP Japan Alumni im DJW
• Arbeitsgruppe Bayern
• Arbeitsgruppe Ost

Ansprechpartner sind jeweils ehrenamtlich tätige DJW-Mitglieder. Zusätzlich organisieren DJW-Mitglieder vor Ort regionale Treffen ("DJW-Kai").